2020-05-26
5月22日,饶子和院士团队与合作单位在新冠病毒重要药物靶点RNA聚合酶(RdRp)复合物的结构与功能研究上取得重要突破。作为饶子和院士团队重要成员之一,天津大学生命科学学院三年级博士研究生王镐锋以并列第一作者身份在国际权威学术期刊《Cell》(《细胞》)杂志上发表了题为Structural basis for RNA replication by the SARS-CoV-2 polymerase研究论文。论文中报道了新冠病毒RNA聚合酶及其辅助因子与RNA和抗病毒候选药物瑞德西韦复合体2.9 的三维结构,揭示了新型冠状病毒聚合酶复合体催化过程中“转位前”和“转位后”两个生理状态的构象特征。
非结构蛋白7(nsp7)和非结构蛋白8(nsp8)作为辅助因子参与形成RNA聚合酶(nsp12)为核心的复合体,但其生理角色一直扑朔迷离。既有的对SARS冠状病毒RNA聚合酶的活性研究表明,nsp7/nsp8对RNA聚合酶介导的RNA复制至关重要。本研究捕捉了反应进入稳定延伸阶段后,与nsp12单独直接结合的以及通过nsp7介导与nsp12结合的两个nsp8分子N端结构域的大幅构象变化。两个nsp8分子的N端交汇形成一个产物RNA向上游退出路径上的一个结构性平台,发挥潜在的稳定RNA转位和帮助其快速行进的作用。至此,非结构蛋白nsp7和nsp8作为RNA聚合酶辅助因子的生理意义和结构基础获得充分阐释。此外,通过将法匹拉韦(Favipiravir,一种鸟嘌呤类似物)与反应中心+1位的鸟嘌呤相比较,对法匹拉韦可能的结合形态给出了合理的提示。
新型冠状病毒聚合酶复合体催化过程中“转位前”状态(B)和“转位后”状态(A),同时“转位前”状态也揭示了新型冠状病毒聚合酶及其辅助因子与RNA和抗病毒候选药物瑞德西韦复合体的结构特征
本研究首次精细描绘出了新型冠状病毒“RdRp-nsp7-nsp8”转录复制机器处在工作状态下的核心特征,展现了复合体辅助部件参与反应的分子机制和结构基础,并为瑞德西韦和法匹拉韦等候选药物的效应分子如何精确靶向抑制病毒RNA合成进而发挥药效活性提出了机制解释。该项成果由上海科技大学、武汉病毒所、天津大学、清华大学等单位联合攻关,通力协作完成。王镐锋系天津大学生命科学学院直博生,本篇论文是天津大学研究生首次以并列第一作者身份在《Cell》杂志上发表论文。
原文链接:
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30629-2#%20